Централна клинична лаборатория с прилежащата ѝ лаборатория по лекарствен и терапевтичен мониторинг и клинична фармакология е оборудвана с най-съвременната апаратура в областта. Тя разполага с:
• Апарат за газова хроматография с пламъковойонозационна и азотселективна детекция (GC-FID/NPD, Agilent Technologies)
• Апарат за високоефективна течна хроматография със спектрометрична и флуоресцентна детекция (HPLC-UV/F, Agilent Technologies)
• Апарат за високоефективна течна хроматография със спектрометрична скенираща детекция (HPLC-PDA, Waters Co)
• Четири системи за течна хрматография с тандем масспектрометрична детекция (LC-MS/MS, QQQ, три на Thermo Scientific и една на SCIEX), последната - с модул SelexION и QTRAP технология.
• Мултиплексен генетичен анализатор (MassARRAY® Dx Analyzer, Agena Bioscience)
• Апарат за хемилуминесцентен имунохимичен анализ (MAGLUMI 2000, Snibe Diagnostic)
• Система за конвенционална и имунофиксационна електрофореза (Sebia)
• Система за ензимно-свързан имуносорбентен анализ (ELISA) за диагностични и изследователски цели (Zenyth 3100, Anthos)


