Структура

Административен сектор
- Обработка на документация
- Оперативни връзки с органите на МВР и Министерство на правосъдието

Танатологично отделение:
- Секционна зала и трупохранилище
-- Съдебномедицинско изследване на трупове и трупни останки
-- Съвременно направление- експертно-научни разработки на морфологична характеристика при огнестрелни наранявания и взривове
-- Съдебно-химическа лаборатория– извършват се изследвания за наличие на алкохол, наркотични вещества, силно упойващи и токсични вещества.
-- Газ-хроматографско изследване за етилов алкохол и летливи редуциращи вещества
-- Определяне на отрови и наркотични вещества чрез тънкослойна и газова хроматография с NPD детектор
-- UV-спектрофотометрично изследване за наличие на лекарствени средства

• Хистологична лаборатория – изготвят се хистологични препарати за изследвания от вътрешни органи.

• Биохизикотехническа лаборатория – извършват се изследвания за индентификация на личността, биотрасологични експертизи и определяне възраст, пол, ръст и други по човешки останки.
-- Идентификация на личността по череп, чрез фотосъпоставяне, по скелетирани кости и фрагменти от тях
Пр.: Определяне на възрастта на човек по съзъбие и единични зъби (недекалцинирани зъбни шлифове с прилагане на математически модел на базата на множествената регресия)
-- Идентификация на посечно оръжие по следи оставени по кост (биотрасология)

- Отделение живи лица и веществени доказателства:
-- Амбулатория за прегледи на живи лица
Престъпления срещу личността:
- Битови конфликти, телесни повреди
- Грабежи
- Опити за убийства
- Полови престъпления
- Полови проявления
- и др.

• Лаборатория за веществени доказателства (обособена през 1961г.), в която се изследват биологични следи по обекти свързани с престъпления. Установяване на следи от различни медико-биологични продукти по предмети носители веществени доказателства:- Видова принадлежност на следи от биологичен произход (кръв, косми, слюнка, сперма, кости и др.); - Кръвно-групова принадлежност; - Механогенеза на следо-образуване; - Предварителна оценка на следите и екстракционни процедури за ДНК анализ

• Лаборатория за ДНК анализ (създадена през 1996г.) в която се извършва изолиране на ДНК, PCR реакция и последваща автоматична флуоресцентно възбудена лазерна детекция с цел идентификация на личността, ДНК профилиране на биологични следи по веществени доказателства, популационни изследвания, ДНК профилиране при спорен родителски произход.

• Серологична лаборатория (обособена през 19 62 г.) – извършват се изследвания на проби кръв /Еритроцитни фактори, Ензимни фактори, Серумни системи/ при спорен родителски произход по кръвно групови фактори.

Компютърен сектор (обособен през 2001г.) в който се извършват текстообработка, база данни, фотографиране и филмиране в аналогов и цифров формат за целите на учебната, експертната и научната дейност, електронна поща и интернет, идентификация на действало острие чрез съпоставяне и сравнителен анализ на дигитални изображения на уврежданията, повредите по дрехите и инкриминирано оръжие, съпоставяне на дигитални изображения на следи от кръв по обект носител със следообразуващата повърхност на инкриминирани предмети чрез наслагване на образи в двуизмерното пространство.